Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXW4P57775 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms