Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR4P51571 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR4P51571 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms