Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRIM1P49642 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms