Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms