Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms