Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A3P48764 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms