Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms