Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTF4P34130 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTF4P34130 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms