Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms