Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMPK1P30085 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMPK1P30085 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms