Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms