Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms