Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT1P26358 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms