Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VCLP18206 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VCLP18206 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms