Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms