Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EPCAMP16422 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms