Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRAFP15056 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRAFP15056 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRAFP15056 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRAFP15056 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms