Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms