Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3P09919 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3P09919 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms