Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB7P09629 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms