Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms