Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR3BO95264 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms