Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCELO95171 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCELO95171 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCELO95171 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCELO95171 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms