Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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