Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APAF1O14727 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
APAF1O14727 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APAF1O14727 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APAF1O14727 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms