Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms