Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMX2A2RU54 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMX2A2RU54 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms