Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms