Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRQQ9UMZ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms