Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms