Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms