Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP4Q9P0V3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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