Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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GDE1Q9NZC3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GDE1Q9NZC3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GDE1Q9NZC3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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GDE1Q9NZC3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GDE1Q9NZC3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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