Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms