Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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