Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms