Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms