Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC3GQ9HC16 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms