Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C11orf49Q9H6J7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C11orf49Q9H6J7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms