Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms