Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms