Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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