Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms