Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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