Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms