Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGMNQ99538 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms