Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX18Q96RF0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms