Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms