Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms