Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DNAJA4Q8WW22 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms